Аниме «Никуко из Рыбацкой гавани» следует за главной героиней и её 11-летней дочерью Кикуко, когда пара пытается выжить в тесном плавучем доме в маленьком портовом городке. Никуко, обосновавшись в своём новом доме после серии «романов», состоявших из того, что её партнеры воспользовались её наивностью и добродушием, тем не менее, по-прежнему безжалостно общительна и оптимистична, к большому огорчению Кикуко. Кикуко пытается познавать окружающий мир и саму себя, но в сложившихся условиях это весьма тяжело. Несмотря на это, она продолжает посещать среднюю школу, общается с ровесниками и не забывает про домашние задания.
